2023年启动的新一轮院士制度改革中，院士增选的推荐机制和评选流程发生了显著变化。

院士推荐方面：

新修订的两院章程称，院士增选实行推荐制，候选人由院士和学术团体推荐。具体而言，在推荐环节，根据两院2023和2025年发布的院士增选工作实施办法，每位院士只能推荐一位候选人。对65岁以下的候选人，2023年以前需要三位院士的联合提名才能入选，现在只需一位来自本学部或专业相近的院士推荐即可。院士手中的“推荐票”从三票降为一票。通过限制名额，院士在推荐候选人时将更慎重，提名的含金量得以提高，避免了“凑数”现象。

评选流程方面：

2023年前，院士评选要经过两轮评审：第一轮，在学部内，由学部常委会组织各专业组和学部全体会议，对被提名人进行评审，产生一份正式候选人名单，随后，各学部再根据当年分配下来的名额，对这些正式候选人实行差额比例为20％的无记名投票，也就是说，候选人中的五分之四可以进入最终的全院投票环节。第二轮，举行全院院士增选大会，终选采取等额选举，无记名投票，获得赞同票数超过投票院士人数二分之一的候选人当选。

改革之后的2023年，第一轮初选环节变为外部同行专家盲评，据悉，两院都建立了外部专家数据库，如长江学者、杰青等更广的学术专家群体被纳入其中。第一轮参评的外部同行以不参评的长江学者、“杰青”、“领军人才”为主，也有部分海外华人学者，每个学部会按照不同专业领域来分组组织外部专家，每组几十人，评审时采取封闭式管理，专家需要独自评审材料和投票，监管严格，三餐饮食都是送饭上门。而且，评审投票的时间总体上被大幅压缩，第一轮外部同行评审只用几天就完成，此后立即进入第二轮大会投票环节，整个评审进程大大加快。

第二轮院士大会投票环节，新一轮改革也进行了调整，从过去的等额投票改为差额投票，规定参会院士按20％差额对候选人投票，获得赞同票数超过投票人数二分之一的候选人，按各专业学部增选名额，根据得票数依序当选院士。由于过去第二轮是等额投票，最核心的筛选过程实际发生在学部内部初选阶段。终选投票几乎只是形式上的走过场，所以在大会投票日，尽管是全体投票，但许多院士不参加。